高一新生入学时，根据中考分数按层次分班。之后在高一文理分科时、高一升高二时、高二升高三时，再根据高中各阶段的成绩，全年级学生重新分班。

分数线如下

清北班:要求:中考分数540分及以上。

实验班:要求:中考分数500分至539.9分。

潜力班:要求:中考分数450分至499.9分。

基础班要求:中考分数400分(暂定)至449.9分。

高考成绩：云南省建水实验中学2019年高考，一本上线人数762人，居红河州第一;600分以上人数219人，居红河州第二。家住昭通市威信县的曹淳治同学，2016年中考534.1分，2019年高考理科裸分693分;家住昆明市石林县的徐子涵同学，2016年中考468分，2019年高考理科裸分682分;家住昭通市永善县的陈恩来同学，2016年中考500.3分，2019年高考文科裸分649分。